三姓主要源自：子姓。

三姓起源一

源于子姓，出自春秋时期宋国君主宋桓公子御说，属于以先祖名字为氏。据史籍《通志·氏族略》记载，宋国有个国君叫子卿，原名叫子御说，是宋湣公(宋闵公)子捷之弟。周庄王姬佗十五年(宋湣公十年，公元前682年)，大夫南宫长万因受到君主戏弄和侮辱，忿杀宋湣公，立公子子游为君。其他诸公子借曹国军队反击，杀公子子游，立公子子御说为君，是为宋桓公。宋桓公这个君主的宠妃特别多，生有七个儿子：子兹甫、子目夷、子三种、子四鱼、子五荡、子六鳞、子七肸。一直到周襄王姬郑元年(宋桓公三十一年，公元前651年)春天，宋桓公病逝，由长子子兹甫继位，也就是后来鼎鼎大名的春秋五霸之二、愚仁宋襄公。

在宋桓公的第三子子三种的后裔子孙中，有以先祖齿序名字为姓氏者，称三氏、种氏，世代相传至今，是非常古老的姓氏之一。

三姓起源二

源于地名，出自满族古居地叁牲，属于以居邑名称为氏。叁牲，亦称三姓，为古女真族居住故地名称，即今黑龙江省的哈尔滨市所辖伊兰市。叁牲的地理位置在牡丹江与松花江合流处，濒松花江南岸，东临倭肯河，城三面江流环绕，为水陆交通要地。虞、夏、商时期，叁牲为肃慎之地；汉、晋时期为挹娄之地，东汉朝中叶至唐朝时期，大批汉族人开始迁居该地；南北朝时期属安骨部的属境；隋朝事情为靺鞨之地；唐朝时期则属忽汗州；辽国时期，叁牲为五国城部之越里吉部地，金国时期属胡里改路(今依兰)，元朝时期于该地设胡里改万户府、斡朵怜万户府(今依兰附近)。明朝时期再置和屯卫。历史上，建州女真曾居于该地，因此在清朝初期称其地为和屯噶珊(古城屯)，后因克宜克勒、努雅勒、祜什哈哩三姓赫哲族人居于该此，因此改称“依兰哈喇”。在满语中，“依兰(yilan)”汉义为“三”，“哈喇(hala)”汉义为“姓”，故称叁牲(三牲、三姓)。后来，舒穆鲁氏赫哲族人又迁来该地。

清康熙五十三年(公元1714年)，满清政府于四姓赫哲族人中挑“放披甲”两百名，编为四旗，自吉林乌喇(今吉林吉林)拣派协领一员统辖。清康熙五十四年(公元1715年)，在叁牲筑城驻守，为清朝前期东北地区的重镇。

清雍正五年(公元1727年)，设置副都统，管理旗务，镇守地方。

清光绪三十三年(公元1907年)农历1月，东北地区建行省，改将军为总督，叁牲改设为依兰府。

清宣统元年(公元1909年)农历4月，依兰府设东北路兵备道，管理依兰、密山、临江(今同江)一带边务及东北沿边兵备事宜，并管理依兰等处关税、交涉事宜，同时裁撤三姓副都统。民国二年(公元1913年)3月，依兰府改置为依兰县，今为黑龙江省依兰市治所之地。在清朝初期，叁牲曾一度为沙皇沙俄所霸侵，后在康熙大帝诏令指挥的著名“雅克萨之战”中被中国军队夺回。其地原住居民多为女真族、蒙古族、鄂伦春族。

其地女真族、赫哲族、蒙古族中多有以居地名称为姓氏，称叁牲氏、叁姓氏、叁布氏等，后多省文简化为汉字单姓，称叁氏，简笔为三氏。

三氏是一个多民族、多源流的姓氏群体，但在今中国大陆的姓氏排行榜上未列入百家姓前一千位，在台湾省则名列地五百六十二位。